產(chǎn)品簡介
轉(zhuǎn)錄組測序（Transcriptome Sequencing）是對某一物種特定時間點或特定條件下的mRNA進(jìn)行高通量測序。轉(zhuǎn)錄組測序能夠動態(tài)反映基因的轉(zhuǎn)錄水平，同時可鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本，并且提供樣品特異的轉(zhuǎn)錄本序列結(jié)構(gòu)信息。
研究內(nèi)容
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有參考基因組 |
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無參考基因組 |
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1) 與參考基因組比對； 2) 基因結(jié)構(gòu)優(yōu)化； 3) 新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測； 4) 可變剪接分析； 5) SNP、Indel分析； 6) 轉(zhuǎn)錄組因子分析； |
1) 轉(zhuǎn)錄組本拼接； 2) Unigene功能注釋； 3) CDS預(yù)測； 4) SNP分析； 5) SSR分析； 6) 轉(zhuǎn)錄組因子分析； |
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7) 樣品相關(guān)性分析； 8) 基因表達(dá)水平分析； 9) 基因表達(dá)差異分析； 10) 差異基因功能富集分析； 11) 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析； 12) 分析結(jié)果可視化。 |
7) 樣品間相關(guān)性分析； 8) 基因表達(dá)水平分析； 9) 基因表達(dá)差異分析； 10) 差異基因功能富集分析； 11) 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析； 12) 分析結(jié)果可視化。 |
結(jié)果展示
送樣建議
1) 樣品類型：總RNA；
2) 樣品濃度：≥50ng/μg；
3) RNA總量：≥1μg；
4) RNA純度：OD260/280：1.8-2.0；OD260/230≥1.8，260處有正常峰值；
5) RNA完整度：電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥6.8（動物）、6.3（植物、真菌），基線平整（軟體等無28S物種）。
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