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產(chǎn)品簡(jiǎn)介
基因組從頭組裝(denovo)是指在不依賴參考基因組的情況下對(duì)真/細(xì)菌進(jìn)行基因組測(cè)序及拼接組裝,從而繪制該物種的全基因組序列圖譜。真菌及細(xì)菌基因組一般較小,真菌在100M內(nèi),采用三代測(cè)序技術(shù)可組裝出較高質(zhì)量基因組。
研究?jī)?nèi)容
1) 數(shù)據(jù)質(zhì)控
2) 基因組組裝;
3) 基因組情況評(píng)估
4) 基因組組分分析:
編碼基因預(yù)測(cè);重復(fù)序列注釋;非編碼RNA預(yù)測(cè);假基因分析
6) 基因功能注釋:
通用數(shù)據(jù)庫注釋:GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam;
7) 分泌蛋白分析;各專用數(shù)據(jù)庫注釋
8) 比較基因組學(xué)分析
結(jié)果展示
送樣建議
1、真菌需純培養(yǎng)以避免雜菌污染,菌絲量200mg以上;
2、DNA要求:總量≥10ug,濃度≥50ng/μl,OD260/280:1.8-2.0,電泳要求:主帶清晰,無降解或輕度降解;
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