產(chǎn)品簡介
BSA（Bulked segregant analysis，BSA），也稱混合分組分析法或集群分離法，是一種簡單快速定位基因的方法。它是將目標(biāo)性狀表型極端的高、低兩組個體的DNA分別混成DNA池，然后利用分子標(biāo)記在兩池中進(jìn)行標(biāo)記和性狀間的關(guān)聯(lián)分析。該方法適用于由單基因控制的質(zhì)量性狀或數(shù)量性狀的主效基因定位。
隨著高通量測序技術(shù)的興起，基于全基因組重測序的BSA方法廣泛地應(yīng)用在糧食作物、經(jīng)濟(jì)作物、蔬菜花卉等物種中，并且成功定位出了許多農(nóng)藝性狀相關(guān)的基因。BSA作為當(dāng)下最流行的基因定位方法，因其具有“快速、準(zhǔn)確、經(jīng)濟(jì)、實用”的特點，正受到廣大育種家的熱烈追捧。
研究內(nèi)容
基于比對分析發(fā)現(xiàn)的SNP、InDel標(biāo)記，進(jìn)行子代SNP、InDel頻率差異分析，然后進(jìn)行目標(biāo)性狀區(qū)域定位，最后進(jìn)行候選基因提取和功能注釋。
結(jié)果展示
送樣建議
1) 親本：目標(biāo)性狀在親本間具有顯著差異；
2) 子代混池：a、質(zhì)量性狀中混池規(guī)模以隱性個體數(shù)目為準(zhǔn)，按照1:1混池；b、數(shù)量性狀的表型值一般會符合正態(tài)分布，為保正基因定位結(jié)果精確性一般選擇表型值為10%~20%的個體進(jìn)行混池為宜。無論質(zhì)量性狀或者數(shù)量性狀，混池規(guī)模建議在30+30以上；
3) 適用群體：a、純合物種，F(xiàn)2、RILs、BC、DH等分離群體均可；b、雜合物種，一般使用F1群體；
4) 組織樣和DNA質(zhì)量要求與全基因組重測序相同。
