產(chǎn)品簡(jiǎn)介
原核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析是針對(duì)原核微生物設(shè)計(jì)開(kāi)展的轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序分析研究。微生物在特定生境或時(shí)期中會(huì)表現(xiàn)出基因表達(dá)差異性，以此應(yīng)對(duì)環(huán)境變化。由于原核生物mRNA沒(méi)有polyA尾結(jié)構(gòu)，所以需要去除核糖體RNA、構(gòu)建鏈特異性文庫(kù)等實(shí)驗(yàn)步驟，最終獲得特定時(shí)期或者環(huán)境下微生物體內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄本（包括mRNA，非編碼RNA等）的表達(dá)量差異信息及功能特征，從而找出關(guān)鍵的差異功能基因。
研究?jī)?nèi)容
1) 測(cè)序質(zhì)量值分布統(tǒng)計(jì)；
2) 測(cè)序堿基質(zhì)量控制；
3) 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)；
4) 與參考基因組比對(duì)分析；
5) 基因表達(dá)定量；
6) RNA-Seq整體質(zhì)量評(píng)估：Insert長(zhǎng)度檢驗(yàn)；測(cè)序隨機(jī)性分析；測(cè)序飽和度分析；
7) SNP分析；
8) 新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)；
9) 基因結(jié)構(gòu)優(yōu)化分析；
10) UTR分析；
11) 反義轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)；
12) 重復(fù)相關(guān)性檢測(cè)（有生物學(xué)重復(fù)）；
13) 不同樣品表達(dá)量對(duì)比（兩個(gè)或以上樣品）；
14) 差異表達(dá)基因篩選（兩個(gè)或以上樣品）；
15) 差異表達(dá)基因聚類(lèi)分析（兩個(gè)或以上樣品）；
16) 差異表達(dá)基因的功能注釋及富集分析(兩個(gè)或以上樣品)： 差異表達(dá)基因GO功能富集；差異表達(dá)基因COG分類(lèi)；差異表達(dá)基因KEGG注釋?zhuān)徊町惐磉_(dá)基因KEGG通路富集分析；
17) sRNA分析。
結(jié)果展示
送樣建議
1) 樣品類(lèi)型：總RNA；
2) 樣品濃度：≥50ng/μg；
3) RNA總量：≥2μg；
4) RNA純度：OD260/280：1.8-2.0；OD260/230≥1.8，260處有正常峰值；
5) RNA完整度：RIN≥6.8。
